快速排序的最坏情况是运行时间为Θ(n²)(Θ读作theta)。这种情况发生在当数组已经有序或者逆序排好的时候,此时划分过程产生的两个区域中有一个没有元素。快速排序的运行时间依赖于划分是否平衡,而平衡与否又依赖于划分时主元素的选择。当每次选取的主元素为最小元素或者最大元素时(例如在分解时每次选取的主元素为待排序数组中的最小元素或最大元素),会导致最坏情况发生,此时其递归表达式为T(n)=T(n - 1)+O(n),根据主方法可得这种情况的时间复杂度为O(n²)。
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